Budowa drogi, tym razem warszawskiej Trasy W-Z i poszerzaniem ulicy Leszno (w tym czasie al. gen. K. Świerczewskiego), wymusiła w 1962 roku przesunięcie kościoła Narodzenia Najświętszej Maryi Panny.
Kościół ważący 6,8 tys. ton został odcięty od fundamentów, a konstrukcja ustawiona na żelbetowym ruszcie i sześć torach z 420 rolkami. Operacja trwała 227 minuty, kościół przesunięto o 21 metrów na północ w miejsce dawnego ogrodu klasztornego. Operacja ta miała miejsce w nocy z 30 listopada na 1 grudnia 1962 roku.
Było to pierwsze w Europie i trzecie na świecie przesunięcie obiektu sakralnego.
Tygodnik „Stolica” pisał wtedy:
Przez cały czas operacji kościół jarzył się światłami, a w środku nie zgasła ani jedna z palących się lamp.
Miejsce dawnej lokalizacji kościoła jest zaznaczone na chodniku i jezdni al. „Solidarności” granitową kostką.